El comité había decidido recurrir a la Suprema Corte para resolver el conflicto de funciones, pero ahora, un nuevo fallo del Tribunal Electoral ordenó al Senado culminar el trabajo que el comité había comenzado. Ante esta situación, los miembros decidieron presentar su renuncia.
A través de un comunicado emitido el 27 de enero de 2025, las magistradas Emma Meza Fonseca y Emilia Molina de la Puente, la doctora Mónica González Contró, el doctor Enrique Pereda Trejo y el magistrado Wilfrido Castañón León anunciaron su decisión de renunciar al Comité de Evaluación del Poder Judicial de la Federación, citando la imposibilidad jurídica de continuar con el proceso.
En su misiva de renuncia, los miembros del comité expresaron su agradecimiento a las Ministras y Ministros de la Corte, así como a todo el equipo de apoyo por su compromiso durante el tiempo que duró el trabajo del comité. Además, reiteraron su compromiso de seguir trabajando en defensa de los derechos humanos, la democracia y el Estado Constitucional de Derecho.
Este evento marca un nuevo capítulo en la historia del Comité de Evaluación, que sigue enfrentando retos legales y políticos en su intento por evaluar a los candidatos al Poder Judicial.